世界上最大的自闭症全基因组测序研究揭示了134个自闭症相关基因

病童医院(SickKids) 的研究人员在迄今为止最大的自闭症全基因组测序分析中发现了与自闭症谱系障碍 (ASD) 相关的新基因和遗传变化，从而更好地了解了这种疾病背后的“基因组结构”。

今天发表在《细胞》杂志上的这项研究使用全基因组测序 (WGS) 来检查 7,000 多名自闭症患者以及另外 13,000 名兄弟姐妹和家庭成员的全基因组。研究小组发现了 134 个与 ASD 相关的基因，并发现了一系列遗传变化，最显着的是基因拷贝数变异 (CNV)，可能与自闭症有关，包括约 14% 的自闭症参与者中与 ASD 相关的罕见变异。

大部分数据来自 Autism Speaks MSSNG 数据库，这是世界上最大的自闭症全基因组数据集，该数据库为自闭症研究人员提供了对数千个测序基因组的免费、开放访问。

“通过对所有参与者的整个基因组进行测序，并在 MSSNG 参与家庭的深入参与形成我们的研究重点，我们最大限度地发挥发现的潜力，并允许分析涵盖所有类型的变异，从最小的 DNA 变化到那些影响整个染色体，”遗传学和基因组生物学高级科学家、SickKids 研究主任、多伦多大学麦克劳克林中心主任 Stephen Scherer 博士说。

Brett Trost 博士是该论文的主要作者，也是 SickKids 遗传学和基因组生物学项目的研究助理，他指出使用 WGS 使研究人员能够发现原本无法检测到的变异类型。

这些变异类型包括复杂的 DNA 重排，以及串联重复扩增，SickKids 最近关于自闭症和重复多次的 DNA 片段之间联系的研究支持了这一发现。研究还检查了母系遗传的线粒体 DNA 的作用，发现它占自闭症的 2%。

该论文还指出了只有一个自闭症患者的家庭与有多个自闭症患者的家庭(称为多重家庭)相比，自闭症遗传学的重要细微差别。令该团队感到惊讶的是，“多基因评分”——通过聚合整个基因组中数千个常见变异的影响计算得出的个体患有自闭症的可能性的估计——在多重家族中并不高。

“这表明，多重家庭中的自闭症可能更可能与从父母那里遗传的罕见的、具有高度影响的变异有关。因为与自闭症相关的遗传学和临床特征都非常复杂和多样，所以像我们使用的那样大数据集对于让研究人员更清楚地了解自闭症的遗传结构至关重要，”Trost 说。

研究小组表示，研究数据可以帮助扩大对可能与 ASD 相关的变异范围的调查，以及努力更好地了解 85% 的遗传原因仍未解决的自闭症个体的贡献者。

在同月发表在《自然通讯》杂志上的一项针对纽芬兰 325 个 ASD 家庭的关联研究中，Scherer 博士的团队发现，同一个体中自发、罕见遗传和多基因遗传因素的组合可能会导致不同的亚型自闭症的类型。

BC 儿童医院研究所的遗传学家和调查员苏珊娜·刘易斯博士诊断了许多参与该研究的家庭，他说：“总的来说，这些最新发现代表了在更好地理解与ASD。这一丰富的数据集还提供了一个机会，可以更深入地研究可能决定个人发展这种复杂疾病的机会的其他因素，以帮助个性化未来的治疗方法。”